制冷系統的控制方式根據人工介入的程度可以分為手動控制方式、手主令遙控方式、局部自動控制方式和全自動控制方式四種。
(1)手動控制方式。手動控制方式是根據操作人員的主觀判斷和意愿來控制系統的運行。其優點是設施簡單、一次性投資少、設備維修量小。缺點是系統運行的優劣取決于操作人員的知識、經驗和責任心，控制質量不但因人而異，即使是同一個人，也會因其情緒或健康等因素的變化而變化。手動控制勞動強度大，滯后性大，穩定性、可靠性和安全性差，難以實現優化控制。目前，在制冷系統中較少采用手動控制方式。
(2)手主令遙控方式。手主令遙控方式的制冷系統一般設有安全保護裝置和主要參數的檢測儀表，還有各個設備運行狀態的顯示信號。檢測儀表、運行信號和運行設備的主令開關一般集中在控制室，需要現場控制的設備在現場也設有控制開關。操作人員根據檢測到的各類參數，對系統的運行狀況進行綜合分析，再結合自己的操作經驗，對系統的運行應該如何調整控制作出判斷并手主令遙控操作有關設備，使系統按需要運行。該控制方式的優點是安全性較好，勞動強度降低調整操作較為及時。缺點是系統運行的合理性仍受人為因素的影響，操作失誤的可能性依然存在。
(3)局部自動控制方式。局部自動控制方式是指將制冷系統的控制劃分成若干個可以相對獨立的單元，對這些局部的單元或單元的局部實行自動控制。各個單元按其主要目標值自動投入或退出運行，有關參數也可進行自動調節，操作人員則根據不同運行狀態和需要，協調各單元回路的次序和連鎖關系。這種控制方式的優點是安全性好，操作人員的勞動強度大大降低，操作失誤可能性大大減少，控制精度提高。缺點是人為因素的影響仍未消除，系統的優化運行仍難以保證。
(4)全自動控制方式。全自動控制方式是對整個制冷系統的運行實行自動控制。通過理論計算并與實際經驗相結合，制定在各種條件下運行的控制程序，合理設定參數的范圍和各種應變的措施，使系統處于既節能又達到高情度的運行工況。操作人員在一般情況下只需對系統運行進行監護。這種控制方式的優點是可以實現節能優化控制，采用不同的調節手段可達到不同的精度要求并可實現無人操作。缺點是投資和維護費用大.對維護人員的專業素質要求高。
制冷系統的自動控制，還可以根據不同的調節手段分為繼電器控制、可編程序控制器控制和計算機控制等方式。這些控制方式之問不能機械地予以劃分，而往往是根據系統中控制的需要來選擇最合理的調節手段，整個控制系統可能是由若干調節手段有機組合而成的自動控制。
