制冷系統充氨后，隨著試運行的進行，冷庫開始降溫。為了保證庫房土建結構免遭破壞，必須緩慢地降溫，每天降溫的速度與庫房的溫度有關。
新建土建冷庫房降溫的速度一般控制在2℃/24h左右，并要維持一段時間暫停，絕對不能一下把庫溫降下來，否則，庫房結構不能適應溫度變化可能產生裂縫。庫房的降溫過程分三個階段進行，即水分凍結前(4℃以上)、水分凍結(-4~4℃)及水分凍結后(-4℃以下)三個階段。
新建冷庫降溫過程因受到進程的限制，在較長的一段時間內回氣壓力會較高。因此，前、中期只宜用單級機緩慢地逐步降溫，后期庫房溫度較低時，才可用雙級機緩慢降溫。
第一步:檢查和調整各控制閥門。冷庫降溫前，應對制冷系統的各控制閥門進行檢查和調整，使需要降溫的庫房低壓系統管道暢通，壓縮機至冷凝器、儲液器和高壓調節站的高壓管路也必須暢通。關緊各庫房門。
第二步:對蒸發器適當供液。降溫開始時，先對蒸發器適當供液，系統內有一定氨液后，照正常起動程序開動氨壓縮機，使機器投入正常運行。
第三步:分段緩慢降溫。調整對蒸發器的供液量，使氨液在系統內不斷正常循環，庫溫逐漸下降。庫房溫度達到一定程度后，應停止供液，關停壓縮機，暫停降溫。等到了規定時間后再繼續降溫，直至達到設計要求的低溫為止。
在整個降溫過程中，應將個別冷庫門稍打開一些，以免由于空氣冷卻收縮引起局部真空而損壞庫房建筑。
第四步:結束降溫操作。當庫溫降到設計位(-28℃)后，應停機封庫24h以上，觀察并記錄庫房自然升溫情況及隔熱效果。
降溫過程中，應注意觀察庫房各冷間內排管的結霜情況，并做好記錄，對結霜不好的管段應進行原因分析。如果是設計安裝不理想所致，應會同設計或安裝單位采取整改措施。如管內有污物堵塞而造成結霜不良，應抽空后切開排除。
冷庫冷凍間降溫操作過程的有關情況，應記錄在表格中。降溫后，如果庫溫回升過快，應檢查隔熱層是否不平或受潮，施工質量是否有問題等。
