庫房內消毒有以下幾種方法。
(1)漂白粉消毒。漂白粉可配制成含有效氯0.3%-0.4%的水溶液(1L水中加入含16%-20%有效氯的漂白粉20g)，在庫內噴灑消毒，或與石灰混合，粉刷墻面。配制時，先將漂白粉與少量水混合制成濃漿，然后加水至必要的濃度。
在低溫庫房進行消毒時，為了加強效果，可用熱水((30-40℃ )配制溶液。用漂白粉與碳酸鈉混合液進行消毒，效果較好。配制方法是，在30L熱水中溶解3.5kg碳酸鈉，在70L水中溶解2.5kg含25%有效氯的漂自粉，將漂白粉溶液澄清后，再倒入碳酸鈉溶液。使用時，加2倍水稀釋。用石灰粉刷時，應加入未經稀釋的消毒劑。
(2)次氯酸鈉消毒。可用2%-4%的次級酸鈉溶液，加入2%碳酸鈉，在低溫庫內噴灑，然后將門關閉。
(3)乳酸消毒。1m3庫房空間需用3-5mL粗制乳酸，每份乳酸再加1~2份清水，放在瓷盤內，置于酒精燈上加熱，再關門幾小時消毒。
(4)福爾馬林消毒。庫溫為20℃以上的庫房，可用3%-5%的甲醛消毒(即7.5%-12.5%的福爾馬林溶液)，1m3空間噴射0.05-0.06kg。在低溫庫房內噴射，效果較差。1m3空間可用15-25g福爾馬林，加入沸水稀釋，與10%-20%的高錳酸鉀同置于鋁鍋中，任其自然發熱和蒸發，閉門1~2d后，經過通風、消毒工作即完成。因福爾馬林氣味很大，肉吸收后即不能食用。為了吸收剩余的福爾馬林，可在通風時用盆等容器盛氨水放在庫內。福爾馬林對人有很大的刺激作用，使用時要注意安全。
