1、氨油分離器在正常運行時上部熱、下部涼。如果油分離器上下部都發熱，供液管也發熱，這就不正常了。主要原因是冷凝器出口與氨油分離之間的液位差所形成重力，不能克服氨油分離器到冷凝器出口的阻力，造成氨液進不來。而氨過熱氣體沿供液管直接進入冷凝器出液管，結果使氨油分離器效率低，同時也影響冷凝器的正常回液。處理方法是在制冷系統大修時，將氨油分離器標高下降或減小管路阻力。
2、氟油分離器故障主要是回油閥(自動)打不開，關閉不嚴密，濾網堵塞。自動回油閥打不開時，將看不見曲軸箱中潤滑油飛濺，回油管長期不熱，分離器中有油回不去。如用木榔頭輕擊回油閥也不見效果時，就應拆卸檢修，檢查浮球是否破裂和閥孔堵塞情況。如果一時不能拆卸，可用手動回油閥定期回油，代替自動回油閥工作。與此相反的現象是回油管長期發熱，或者發涼結霜。當自動回油閥浮球機構卡住、閥針腐蝕、閥針孔有臟物雜質卡住閥針時，回油管是會長期發熱的。如果閥針孔關閉不嚴，則閥針孔就起了節流作用，使回油管發涼或結霜。
氟油分離器濾網的堵塞一般少見，但若出現這種情況，其后果是嚴重的。這時高壓上升很快達到報警壓力，繼電器動作而停止壓縮機運行，氟油分離器進出管上出現了明顯的溫差，這種現象發生在于缺乏日常維護。制冷壓縮機吸氣過濾網長期不清洗，甚至過濾網穿孔，一些纖維物質，經汽缸而進入油分離器。另外在檢修汽缸時可能將擦拭汽缸的布料放在排氣口，而裝汽缸蓋時，又疏忽大意，于是臟物在高壓下，被推至油分離器濾網處將其堵塞。
