壓縮機要根據庫房熱負荷進行調配，如凍結間剛進熱貨時，制冷劑蒸發溫度會急劇上升，有時會從-33℃升到-18℃。此時可用單級壓縮機降溫，當壓縮比大于8后，再用雙級壓縮式制冷系統降溫。如果凍結間較多，進行繼續性生產，系統中有幾個蒸發溫度時，一般不做換機運轉。肉溫從0℃降到-5℃時，熱負荷最大，應適當增加雙級壓縮，以適應降溫的要求。但必須指出，如將運轉中的單級壓縮機配組為雙級壓縮機運轉，必須先將運轉中的單級壓縮機停止運轉，然后調整排氣閥門及其他閥門，調整無誤后，重新啟動機器。嚴禁在運轉中的壓縮機不停止運轉時調整閥門，以免造成嚴重事故的發生。
當壓縮機制冷量大于冷間熱負荷時，應調換制冷量較小的制冷壓縮機或者利用能量調節裝里部分卸載運轉。
當運轉中的壓縮機與新降溫的房間相連通時，應密切注意機器的回氣壓力和溫度，如吸氣壓力上升，吸氣溫度下降，應迅速關小壓縮機的吸入閥，防止機器濕行程。
