冷凍間是對進入冷庫的商品進行冷凍和加工的場所。貨物在進入冷藏或者冷凍庫房以前，應先在冷凍間進行冷凍處理，使貨物均勻降溫至預定的溫度。否則，當貨物溫度較高，濕度較大時，直接進入冷藏或冷凍庫會產生霧氣，影響庫房的結構。
對于冷藏貨物，一般降至2-4℃，冷凍貨物則迅速降至一20℃使貨物凍結。為了使貨物合理冷凍，在冷凍間應將貨物分散存放，以使其均勻降溫。由于預冷作業只是短期的作業，貨物不堆垛。一般處于較高的搬運活性狀態，多數直接放置在搬運設備上，如放置在推車上或托盤上。
冷卻貨物冷藏間是溫度保持在0℃左右的冷庫，用于儲存冷卻貨物。貨物經預冷后達到均勻的保藏溫度時送入冷庫堆碼存放，或者少量常溫貨物直接送入冷藏間冷藏。因為冷藏貨物特別是果菜類貨物對庫溫有較高的要求，不允許有較大的波動，所以冷藏間還需要進行持續的冷處理。為防止貨垛內升溫，保持冷藏間冷空氣的流通，冷藏間一般采用列垛的方式堆碼。
另外，對于果蔬冷庫還需要安裝換氣裝置，以滿足果蔬貨物的呼吸要求。
冷庫設計穿堂的目的是防止庫內外或不同溫度冷庫在開門進出貨物時，減少外界溫度對庫內環境溫度的沖擊，并可作為各冷藏間貨物進出冷庫的通道，起到溝通冷庫各冷藏間，便于冷藏貨物裝卸及周轉的作用。
