冷凍潤滑油雖然可以給制冷系統正常工作帶來保證，但也會引起一些問題，這主要反映在以下兩個方面。
1.冷凍潤滑油的黏度對制冷系統的影響。黏度是冷凍潤滑油的主要性能指標之一。如果黏度高，會使摩擦功率增大，起動力矩大；黏度過低，則會降低潤滑的質量。
2.冷凍潤滑油的溶解性對制冷系統的影響。冷凍潤滑油的溶解性是對制冷劑而言的，對不同的制冷劑，溶解性不同。R22制冷劑與冷凍潤滑油相溶程度受溫度的影響，在低溫區溫度降低到一定程度時，制冷劑和冷凍潤滑油分層流動，影響制冷劑吸放熱效果，并使冷凍潤滑油也不易被壓縮機吸回。
R12等制冷劑與冷凍潤滑油可以互溶，但由于冷凍潤滑油是一種高溫蒸發的液體。制冷劑中溶油量多，會使制冷劑在定壓下沸點升高，降低制冷量；同時，冷凍潤滑油中的制冷劑過多，也會稀釋冷凍油，降低冷凍潤滑油的黏度。
