果蔬運輸的裝載方法，是影響運輸質量的重要因素。對于有呼吸熱的果蔬產品來說，裝載的基本原則是：
1.在各貨件之間留有一定的間隙，使車內空氣能在貨物之間流動，使每件貨物都能接觸冷空氣，以利于呼吸熱的散發。
2.裝載牢固，以防止移動、碰撞、振動造成的損傷。適于果蔬裝載的堆碼方法主要有：
(1)品字形或方格式，適于箱裝果蔬。“品字形”為把奇、偶數層的貨件“騎縫裝載”，使呈品字形。這種方法只能在車輛的縱向形成通風道，不便上下及橫向通風，但裝載牢靠。適于制冷能力強，有強制通風裝置的機冷車。“方格式”即把貨件上下對齊，前后靠緊，縱向貨件間留30~ 40mm間隙，每層貨件間加20mm × 40mm截面的木墊條。這種方法每件貨物側面及上下均能接觸冷空氣，空氣循環好，適于各種冷藏車。但貨件只是前后靠緊，左右不接觸，故裝載不牢固。
(2）筐口對裝法。適于各種筐包裝果蔬。此法利用筐上大下小的形狀，采取筐口對筐口筐底對筐底的裝載法。相鄰貨件之間取反向對裝時不形成通風道，而相鄰貨件之間取同向對裝時則形成通風道，故此法通風道的設置非常靈活，裝載也較牢固。
除上述兩種常用方法外，如包裝為長條形木箱，則可取井字形裝載，每四箱貨物中間可有一垂直通風道。
裝車時，貨件不應直接堆放，也不應緊靠車壁。車底板上要有完好底格板。如用冷藏車裝載對低溫敏感的果蔬時，貨件也不能緊靠冷源(冷風出口、冰箱擋板等)，以免凍壞。必要時須在上述部位蓋草袋，使低溫空氣不直接接觸貨件。
果蔬的裝卸作業最好在夜間進行。因夜間溫度低，無太陽輻射。如必須在白天作業時，裝卸場地應有防曬、防雨設施。
果蔬的裝卸應盡可能在短時間內完成。鐵路部門對每種冷藏車都規定有裝卸時限。裝載已預冷的果蔬時，作業不得中斷，裝車后應及時關門密封，減少外界熱量傳入。
在我國由于現有條件的限制，果蔬運輸的絕大部分是未經預冷的。通常采用的補償辦法為在包裝間夾冰塊，夾冰運輸尤其適用于綠葉蔬菜、青椒等，可加速貨溫的下降，減少干耗。是保溫車的常用措施及普通篷車運輸的必要措施。
包裝內夾的碎冰大小要適當，過小融化快，運輸溫度回升快，過大易磨、壓傷貨物。夾冰量可依據車輛熱平衡方程計算。在實踐中，往往根據各種運輸條件(品種、包裝、外溫、遠距、車型等)估計。一般在蔬菜中夾冰20% ~40 %。
有時，芹菜、青蒜苗等在包裝缺少的情況下，亦做散裝運輸。在散裝的情況下，除應分層夾冰外，還應視情況插入通風筒，以利散熱。
