使用機械冷藏車運輸時，應在途中每隔一定時間做好溫度記錄。鐵路規定記錄溫度的間隔為2h，并每隔6h填寫一次冷藏車作業單。一般機冷車的溫度控制可自動進行。故溫度管理反而簡單。
在使用加冰冷藏車時，車內的低溫靠冰的消耗來維持。在運輸距離較長時，往往需要中途加冰。因此，鐵路、加冰冷藏車必須按指定路線在有中途加冰所的線路上運行，有時，為此目的需繞道運行。
加冰冷藏車的途中加冰作業主要為，在始發站根據列車的熱消耗預測冰消耗量，并向前方加冰所發出加冰預報。到達加冰所后，應即檢查車內溫度、殘冰情況，并按需要量加足冰或冰鹽。同時向下一個加冰所或到站發出預報。
在長途運輸中，往往運輸沿線的外界氣溫有很大差別。如在10月份由廣州往滿洲里運香蕉，廣州的平均外溫為23℃，滿洲里為0℃。在這種情況下，往往要視具體情況，先用冷藏運輸，在途中的適宜區段采用不制冷的保溫運輸或通風運輸，而在嚴寒地段降溫超過允許幅度時，則要采用加溫防寒運輸，以保證貨溫的穩定。
