冷藏集裝箱采用鍍鋅鋼結構，箱內壁、底板、頂板和門由金屬復合板、鋁板、不銹鋼板或聚酯一膠合板制造。大多采用聚氨基甲酸酯泡沫作隔熱材料。
目前，國際上集裝箱尺寸和性能都已標準化。標準集裝箱基本上是三類:20 x 8 x 8,20 x8 x8.6,40 x 8x9.6(長x寬x高,ft,1ft=0.3m)。使用溫度范圍為-30℃(用于運送凍結食品)到12℃(用于運送香蕉等果疏)，更通用的范圍是-30~20℃。我國目前生產的冷藏集裝箱主要有兩種外形尺寸:6058mm x2438mm x 2591 mm和12192mm x2438mm x2896mm。
冷藏集裝箱必須具有良好的隔熱性能。內藏式冷藏集裝箱的制冷裝置必須穩定可靠，通用性強，并配有實際溫度自動檢測記錄和信號報警裝置。對大型冷藏集裝箱船，可裝運100~1000個集裝箱，其精確控制往往由微型計算機進行數據處理和自動記錄。
